MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori 52 chromosome

Total Repeats: 32580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017354	T	6	6	21	26	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017354	GAGC	2	8	68	75	25 %	0 %	50 %	25 %	384887044
3	NC_017354	CATT	2	8	154	161	25 %	50 %	0 %	25 %	384887044
4	NC_017354	GAT	3	9	162	170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887044
5	NC_017354	T	6	6	299	304	0 %	100 %	0 %	0 %	384887044
6	NC_017354	GTT	2	6	345	350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384887044
7	NC_017354	T	7	7	358	364	0 %	100 %	0 %	0 %	384887044
8	NC_017354	T	7	7	386	392	0 %	100 %	0 %	0 %	384887044
9	NC_017354	TTC	2	6	396	401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887044
10	NC_017354	ACA	2	6	422	427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384887044
11	NC_017354	ACC	2	6	433	438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384887044
12	NC_017354	C	6	6	440	445	0 %	0 %	0 %	100 %	384887044
13	NC_017354	AAT	2	6	497	502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384887045
14	NC_017354	C	6	6	682	687	0 %	0 %	0 %	100 %	384887045
15	NC_017354	AAC	2	6	737	742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384887045
16	NC_017354	CT	3	6	743	748	0 %	50 %	0 %	50 %	384887045
17	NC_017354	CTT	2	6	840	845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887045
18	NC_017354	ATCT	2	8	849	856	25 %	50 %	0 %	25 %	384887045
19	NC_017354	TGA	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887045
20	NC_017354	AAAT	2	8	952	959	75 %	25 %	0 %	0 %	384887046
21	NC_017354	TCA	2	6	998	1003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384887046
22	NC_017354	CCG	3	9	1083	1091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384887046
23	NC_017354	CCA	2	6	1227	1232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384887046
24	NC_017354	GCT	2	6	1252	1257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384887046
25	NC_017354	CA	3	6	1266	1271	50 %	0 %	0 %	50 %	384887046
26	NC_017354	T	6	6	1283	1288	0 %	100 %	0 %	0 %	384887046
27	NC_017354	T	6	6	1387	1392	0 %	100 %	0 %	0 %	384887046
28	NC_017354	ATA	2	6	1400	1405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384887046
29	NC_017354	GGC	2	6	1443	1448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384887046
30	NC_017354	GCTT	2	8	1495	1502	0 %	50 %	25 %	25 %	384887046
31	NC_017354	CT	3	6	1601	1606	0 %	50 %	0 %	50 %	384887046
32	NC_017354	TAAAA	2	10	1641	1650	80 %	20 %	0 %	0 %	384887046
33	NC_017354	GTT	2	6	1663	1668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384887046
34	NC_017354	TAG	2	6	1686	1691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887046
35	NC_017354	CTT	2	6	1697	1702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887046
36	NC_017354	TTC	2	6	1802	1807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887047
37	NC_017354	A	7	7	1817	1823	100 %	0 %	0 %	0 %	384887047
38	NC_017354	ATTATA	2	12	1835	1846	50 %	50 %	0 %	0 %	384887047
39	NC_017354	CCTG	2	8	1850	1857	0 %	25 %	25 %	50 %	384887047
40	NC_017354	ATG	2	6	1863	1868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887047
41	NC_017354	CCAA	2	8	1874	1881	50 %	0 %	0 %	50 %	384887047
42	NC_017354	TCA	2	6	1900	1905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384887047
43	NC_017354	TGAA	2	8	1914	1921	50 %	25 %	25 %	0 %	384887047
44	NC_017354	TTG	2	6	1938	1943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384887047
45	NC_017354	T	6	6	2016	2021	0 %	100 %	0 %	0 %	384887047
46	NC_017354	TTC	2	6	2024	2029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887047
47	NC_017354	CAT	2	6	2092	2097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384887047
48	NC_017354	AATG	2	8	2104	2111	50 %	25 %	25 %	0 %	384887047
49	NC_017354	AAT	2	6	2144	2149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384887047
50	NC_017354	TAG	2	6	2197	2202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887047
51	NC_017354	G	6	6	2229	2234	0 %	0 %	100 %	0 %	384887047
52	NC_017354	ATTC	2	8	2389	2396	25 %	50 %	0 %	25 %	384887047
53	NC_017354	A	8	8	2581	2588	100 %	0 %	0 %	0 %	384887048
54	NC_017354	TCTT	2	8	2597	2604	0 %	75 %	0 %	25 %	384887048
55	NC_017354	T	7	7	2677	2683	0 %	100 %	0 %	0 %	384887048
56	NC_017354	T	7	7	2719	2725	0 %	100 %	0 %	0 %	384887048
57	NC_017354	AGC	2	6	2817	2822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384887048
58	NC_017354	GC	3	6	2830	2835	0 %	0 %	50 %	50 %	384887048
59	NC_017354	A	6	6	2868	2873	100 %	0 %	0 %	0 %	384887048
60	NC_017354	AG	3	6	2987	2992	50 %	0 %	50 %	0 %	384887048
61	NC_017354	GTG	2	6	3006	3011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384887048
62	NC_017354	T	6	6	3059	3064	0 %	100 %	0 %	0 %	384887048
63	NC_017354	AGA	2	6	3104	3109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384887048
64	NC_017354	CAAA	2	8	3140	3147	75 %	0 %	0 %	25 %	384887048
65	NC_017354	GTG	2	6	3165	3170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384887048
66	NC_017354	GCC	2	6	3172	3177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384887048
67	NC_017354	TGC	2	6	3257	3262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384887049
68	NC_017354	GAAA	2	8	3287	3294	75 %	0 %	25 %	0 %	384887049
69	NC_017354	GAAA	2	8	3362	3369	75 %	0 %	25 %	0 %	384887049
70	NC_017354	AGTG	2	8	3383	3390	25 %	25 %	50 %	0 %	384887049
71	NC_017354	TG	3	6	3469	3474	0 %	50 %	50 %	0 %	384887049
72	NC_017354	ACGA	2	8	3510	3517	50 %	0 %	25 %	25 %	384887049
73	NC_017354	GGT	2	6	3617	3622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384887049
74	NC_017354	ATC	2	6	3702	3707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384887049
75	NC_017354	A	6	6	3906	3911	100 %	0 %	0 %	0 %	384887049
76	NC_017354	ATT	2	6	3946	3951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384887049
77	NC_017354	GGC	2	6	4019	4024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384887049
78	NC_017354	GGT	2	6	4123	4128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017354	TAT	2	6	4171	4176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017354	TGG	2	6	4215	4220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017354	ATGC	2	8	4319	4326	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017354	TGG	2	6	4335	4340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017354	GTG	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017354	ACC	2	6	4483	4488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017354	GGT	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017354	A	7	7	4617	4623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017354	T	8	8	4637	4644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017354	AAT	2	6	4658	4663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017354	A	6	6	4818	4823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017354	ATT	2	6	4852	4857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017354	T	6	6	4870	4875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017354	A	6	6	4880	4885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017354	A	6	6	4896	4901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017354	TGT	2	6	4935	4940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017354	TTTTA	2	10	4954	4963	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017354	TC	3	6	4999	5004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017354	A	6	6	5032	5037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017354	T	7	7	5042	5048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017354	ACTA	2	8	5084	5091	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017354	A	6	6	5096	5101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017354	AGT	2	6	5165	5170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017354	AAAAAG	2	12	5181	5192	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017354	C	6	6	5199	5204	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
104	NC_017354	A	7	7	5218	5224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017354	A	6	6	5235	5240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017354	CCATG	2	10	5400	5409	20 %	20 %	20 %	40 %	384887050
107	NC_017354	GCTT	2	8	5425	5432	0 %	50 %	25 %	25 %	384887050
108	NC_017354	T	6	6	5431	5436	0 %	100 %	0 %	0 %	384887050
109	NC_017354	CATT	2	8	5496	5503	25 %	50 %	0 %	25 %	384887050
110	NC_017354	ATT	2	6	5518	5523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384887050
111	NC_017354	TGG	2	6	5616	5621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384887050
112	NC_017354	A	6	6	5728	5733	100 %	0 %	0 %	0 %	384887050
113	NC_017354	C	6	6	5748	5753	0 %	0 %	0 %	100 %	384887050
114	NC_017354	A	6	6	5770	5775	100 %	0 %	0 %	0 %	384887050
115	NC_017354	GTT	2	6	5818	5823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384887050
116	NC_017354	TAA	2	6	5887	5892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384887050
117	NC_017354	TTA	2	6	5945	5950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384887050
118	NC_017354	GTG	2	6	6014	6019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384887050
119	NC_017354	GTT	2	6	6034	6039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384887050
120	NC_017354	CGTG	2	8	6073	6080	0 %	25 %	50 %	25 %	384887050
121	NC_017354	TCT	2	6	6158	6163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887050
122	NC_017354	C	6	6	6180	6185	0 %	0 %	0 %	100 %	384887050
123	NC_017354	AGT	2	6	6246	6251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887050
124	NC_017354	TTTGA	2	10	6289	6298	20 %	60 %	20 %	0 %	384887050
125	NC_017354	GCTTGC	2	12	6320	6331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384887050
126	NC_017354	AGA	2	6	6367	6372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384887050
127	NC_017354	TTG	2	6	6490	6495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384887050
128	NC_017354	TGC	2	6	6616	6621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384887050
129	NC_017354	TGG	2	6	6648	6653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384887050
130	NC_017354	ACC	2	6	6679	6684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384887050
131	NC_017354	AGT	2	6	6688	6693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887050
132	NC_017354	CTTG	2	8	6711	6718	0 %	50 %	25 %	25 %	384887050
133	NC_017354	CTATTA	2	12	6731	6742	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384887050
134	NC_017354	ACT	3	9	6748	6756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384887050
135	NC_017354	CCG	2	6	6788	6793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384887050
136	NC_017354	TTG	2	6	6808	6813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384887050
137	NC_017354	AT	3	6	6824	6829	50 %	50 %	0 %	0 %	384887050
138	NC_017354	CTT	2	6	6879	6884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384887050
139	NC_017354	TTG	2	6	6892	6897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384887050
140	NC_017354	GAT	2	6	6898	6903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887050
141	NC_017354	TCA	2	6	6932	6937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384887050
142	NC_017354	TGGT	2	8	7006	7013	0 %	50 %	50 %	0 %	384887050
143	NC_017354	CCGTTC	2	12	7049	7060	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384887050
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146	NC_017354	ATCG	2	8	7189	7196	25 %	25 %	25 %	25 %	384887050
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148	NC_017354	CGTT	2	8	7224	7231	0 %	50 %	25 %	25 %	384887050
149	NC_017354	T	6	6	7297	7302	0 %	100 %	0 %	0 %	384887050
150	NC_017354	A	6	6	7363	7368	100 %	0 %	0 %	0 %	384887050
151	NC_017354	GA	7	14	7402	7415	50 %	0 %	50 %	0 %	384887050
152	NC_017354	T	7	7	7425	7431	0 %	100 %	0 %	0 %	384887050
153	NC_017354	TGT	2	6	7552	7557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017354	A	15	15	7561	7575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017354	G	6	6	7613	7618	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017354	TTG	2	6	7640	7645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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266	NC_017354	AG	3	6	12732	12737	50 %	0 %	50 %	0 %	384887054
267	NC_017354	TTTG	2	8	12740	12747	0 %	75 %	25 %	0 %	384887054
268	NC_017354	T	6	6	12760	12765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_017354	T	6	6	12825	12830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_017354	AGG	2	6	12831	12836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
271	NC_017354	TGCA	2	8	12839	12846	25 %	25 %	25 %	25 %	384887055
272	NC_017354	TGGTG	2	10	12862	12871	0 %	40 %	60 %	0 %	384887055
273	NC_017354	GA	3	6	12903	12908	50 %	0 %	50 %	0 %	384887055
274	NC_017354	TTA	2	6	12918	12923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384887055
275	NC_017354	GAA	2	6	12935	12940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384887055
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415	NC_017354	AGAA	2	8	19690	19697	75 %	0 %	25 %	0 %	384887061
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442	NC_017354	ATG	2	6	21386	21391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887063
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472	NC_017354	T	8	8	22913	22920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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479	NC_017354	ATT	2	6	23503	23508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384887064
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482	NC_017354	GTA	2	6	23722	23727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384887064
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499	NC_017354	T	8	8	24695	24702	0 %	100 %	0 %	0 %	384887064
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